日本帝國在戰爭中就攻佔澎湖（1895年3月26日），給台灣本島極大的衝擊。台灣士紳聽到清廷將割台，紛紛向清廷抗議其岐視台灣。反對割台之住民發動罷工，有些地方發生暴動。邱逢甲在新竹聚眾唱儀獨立。

5月8日，馬關條約生效，9日，唐景崧署巡撫與英國駐台海關稅務司馬士（H. B. Morse）討論「民主國（republic）」的問題。5月15日，邱逢甲率領台灣士紳與唐巡撫密談，會談後發表《台民布告》，表明「台民獨立」的意圖，呼籲各國承認台灣獨立。台灣士紳又電稟總理衙門、北洋大臣、南洋大臣、閩浙總督、福建藩台及全台官憲謂：「台灣為朝廷棄地，百姓無依，惟有死守，據為島國，遙戴皇靈，為南洋屏蔽」，表明創立獨立國的意圖。

清廷對此情勢開御前會議，討論對策，卻毫無結論。及至20日，免除唐景崧台灣省署巡撫的職務，命其即刻赴北京，同時也命令在台大小文武各官回到大陸。很多官兵遵命回大陸去了。

21日，陳季同以及台灣士紳邱逢甲、林朝棟、陳儒林等人決定公推唐景崧為人民的主宰者。23日終於發表台灣獨立宣言，24日英譯本送交在台各國領事館，宣佈自5月25日起，台灣獨立，國號「台灣民主國」（Republic of Formosa, The Taiwan Republic），也就是台灣民國、台灣共和國之意。

5月25日，照預定舉行獨立儀式。部分台灣士紳至巡撫衙門，將刻有「台灣民主國總統之印」的印璽獻給唐景崧。台北變成台灣民主國的首都。基隆砲台發出21響的祝賀砲聲。26日，台灣共和國的國旗──藍地黃虎的「虎旗」昇起來了。

真正從事抗日的是台灣本地募集的義勇兵，尤其是客家軍。總統唐景崧看到日本軍於5月29日登陸陸台灣東北端的澳底，6月4日就逃亡了。因此有些學說認為台灣民主國的壽命只有11天。

總統跑了以後，駐在台南的黑旗軍劉永福繼續了民主國的香火。他在台南也設了一些政府機構，但是事實上也發生很少作用。劉永福在台南發行台灣民主國股份票、台灣民主國郵票，其實郵票也不盡用做郵票，後來住民要內渡大陸時，繳納郵票當做「避難稅」。不過總算留給我們做台灣民主國的紀念品。日本軍進逼台南，10月19日劉永福也逃到大陸去，10月21日日軍進入民主國的最後據點台南。我認為台灣民主國的歷史到此為止。一共是4個月又26天，日數是148天。…
不是真獨立的台灣民主國�黃昭堂著 (01/03/2002)

台灣小史+日本佔領台灣的經過
黃昭堂著 廖為智譯

台灣民主國國旗